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單細(xì)胞水平如何進(jìn)行基因表達(dá)分析?

作者:admin 信息來源:達(dá)科為 日期:20190612 打印 字體:  
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炎炎夏日,今天給大家介紹一款用于單細(xì)胞水平基因表達(dá)分析的神器。


基因表達(dá) (gene expression) 是指細(xì)胞在生命過程中,把儲存在DNA中的遺傳信息經(jīng)過轉(zhuǎn)錄和翻譯,轉(zhuǎn)變成具有生物活性的蛋白質(zhì)分子(或RNA分子)。很多疾病的發(fā)生發(fā)展、很多藥物的作用機(jī)理、很多生物的代謝調(diào)控作用等都和基因表達(dá)的變化有關(guān),因此對基因表達(dá)進(jìn)行分析十分重要。由于基因表達(dá)是在單個細(xì)胞水平進(jìn)行調(diào)控,所以需要用多種方法來分析單個細(xì)胞如干細(xì)胞、神經(jīng)元、發(fā)育組織、激光捕獲切片的基因表達(dá)方式。

為了便于研究單細(xì)胞的基因表達(dá),美國Signosis公司開發(fā)出一種基于SYBR Green的單細(xì)胞實(shí)時熒光定量RT-PCR檢測試劑,該試劑可以使用細(xì)胞裂解液直接檢測基因表達(dá)水平,無需RNA制備過程。

* SYBR Green是廣泛用于雙鏈DNA的特異性染料,常用作實(shí)時熒光定量PCR報(bào)告染料。

 

小編說了半天,下面正式Pick出今日介紹的主角:


貨號

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

目錄價(jià)

品牌

CL-0003

單細(xì)胞實(shí)時熒光定量RT-PCR檢測試劑

10次

¥5,449

Signosis

與其他定量試劑盒相比,Signosis的試劑盒原理是什么?不同之處?優(yōu)點(diǎn)是?

1)試劑盒包括cDNA合成和PCR擴(kuò)增的所有試劑:

? 細(xì)胞裂解液(1mL)

? Oligo dT

? 隨機(jī)引物

? 反轉(zhuǎn)錄buffer預(yù)混液

? 反轉(zhuǎn)錄酶

? 對照引物

? SYBR Green PCR預(yù)混液


2)您只需要準(zhǔn)備:目的基因特異性引物

3)不同之處在于:無需額外制備/提取細(xì)胞RNA


4)原理圖:


圖1 試劑盒原理:細(xì)胞裂解液裂解細(xì)胞后直接進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄及隨后的 PCR分析。 

5)結(jié)果展示:


圖2  A: 比較Signosis與其他品牌的細(xì)胞裂解液。分別對裂解產(chǎn)物中的β-actin進(jìn)行30個循環(huán)反轉(zhuǎn)錄PCR。 


B: 基因組DNA污染檢測。Lane1:細(xì)胞裂解產(chǎn)物不經(jīng)過反轉(zhuǎn)錄直接對β-actin進(jìn)行36個循環(huán)PCR擴(kuò)增;Lane2:細(xì)胞裂解液反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA后對β-actin進(jìn)行36個循環(huán)PCR擴(kuò)增。 


圖3 細(xì)胞裂解產(chǎn)物中檢測靶基因。

隨著HeLa細(xì)胞數(shù)的增加,分別用適量細(xì)胞裂解液裂解細(xì)胞后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,而后在7700 PCR儀上進(jìn)行Actin、GAPDH和B2M基因的3復(fù)孔qPCR反應(yīng)。 

 

6)產(chǎn)品優(yōu)點(diǎn):

? 一站式 — 試劑盒包含了從細(xì)胞裂解、反轉(zhuǎn)錄到PCR的所有試劑

? 無需RNA制備 — 細(xì)胞裂解產(chǎn)物可直接用于反轉(zhuǎn)錄

? 功能強(qiáng)大 — 該試劑可獲得全長的cDNA

? 實(shí)時監(jiān)控 — 整個分析過程可以實(shí)時監(jiān)控

7)FAQs:

a. 細(xì)胞裂解液能使用幾次?

每個試劑盒里包含1mL的細(xì)胞裂解液:

待裂解細(xì)胞數(shù)

細(xì)胞裂解液用量/次

使用次數(shù)

1000-10000

50ul

20次

50-1000

20ul

50次

1-50

5ul

200次

b. 有沒有儀器要求?

兼容SYBR Green的PCR儀。


更多信息請點(diǎn)擊Signosis官網(wǎng)

www.signosisinc.com



Signosis(美國):是一家專業(yè)的生物試劑產(chǎn)品供應(yīng)商,致力于基于微孔板分析技術(shù)的生命科學(xué)研究產(chǎn)品的開發(fā)、生產(chǎn)和銷售。Signosis成立于2007年,公司專注于細(xì)胞因子、轉(zhuǎn)錄因子、miRNA及疾病標(biāo)志物等重要調(diào)控因子和標(biāo)志物的研究,基于自有專利技術(shù),開發(fā)完成400多種先進(jìn)而獨(dú)特的用于發(fā)現(xiàn)、篩選和分析的生命科學(xué)研究產(chǎn)品。

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